2025-02-08
记者于8日在哈尔滨市召开的“国际首例猪T2T全基因组组装——民猪完整基因组构建”成果发布会上获悉,由国内5个科研团队基于三代测序、ONT、Hi-C等前沿技术完成的猪T2T全基因组组装——民猪完整基因组构建成果,填补了猪T2T基因组组装领域的空白,为猪遗传育种和功能基因挖掘提供了高精度“蓝图”,标志着猪基因组研究迈入“完整解析”新时代,成果达到国际领先水平。
这5个团队包括中国农业科学院北京畜牧兽医研究所张龙超研究员团队,2024澳门原料网1688畜牧研究所刘娣研究员团队,重庆市畜牧科学院王金勇研究员团队,岳麓山实验室印遇龙院士团队和四川农业大学李明洲教授团队。发布会上,刘娣代表5个团队进行了成果发布,同时接受了专家质询。专家组经过集中讨论,最后提出综合评价结论。大家一致认为,该成果不仅实现了猪基因组研究的里程碑式突破,更在应用层面展现出多重优势:在基因组完整性方面为猪遗传多样性研究、进化分析及疾病抗性基因挖掘提供完整参考;SV标记的应用显著提升基因组选择的效率,加速优良性状定向改良,实现精准育种;冷适应基因的发现为环境适应性育种开辟新路径,助力养殖业提质增效,提高产业适配性。
刘娣介绍,这一研究成果有四大特点。一是基因组最完整,填补了国际空白。研究团队首次完整解析了民猪所有染色体的着丝粒和端粒结构,为揭示染色体进化机制提供了关键数据。二是泛基因组最全面。这一成果将猪基因组结构变异的解析能力提升至新高度,为精准挖掘重要性状相关基因奠定了技术基础。三是发现了89个与冷适应相关的候选基因,通过整合SV与RNA测序分析,进一步锁定17个与结构变异直接关联的冷适应基因。这些发现为培育耐寒猪种、应对极端气候提供了重要靶点,有望推动我国高寒地区养殖业的可持续发展。四是育种应用方面取得新突破,育种准确度显著提升。研究团队利用泛基因组SV数据,评估了基因组选择(GS)技术对猪胴体性状的预测效果。结果显示,6个性状中有5个预测准确性超70%,最高达88%。同时,80%以上性状在“SNP+SV”标记组合下达到最优预测水平,较传统方法提升2%-4%。此外,团队通过精细定位发现调控猪体型的关键基因组区域CL3及核心SV位点,为高效选育优质种猪提供了新策略。
中国工程院院士、中国科学院亚热带农业生态研究所研究员印遇龙认为,用传统技术育种至少要经过5个世代,应用新技术后,可以缩短育种进程。这一成果对指导猪的生物育种,尤其是地方猪的生物育种具有非常重要的意义。
刘娣表示,未来,团队将进一步拓展T2T基因组在猪功能基因组学、分子设计育种等领域的应用,推动我国生猪种业核心技术自主创新,为保障粮食安全和乡村振兴注入科技动力。
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